Prirodoslovni muzej Dubrovnik prva je institucija unutar povijesne gradske jezgre koja je u suradnji sa Agencijom za energetiku i informacijske tehnologije d.o.o. (EnergIT) izradila energetski certifikat zgrade javnog karaktera financiran bespovratnim sredstvima IPA Adriatic fonda.
Kako javljaju iz te ustanove, proveden je energetski pregled objekta te je izrađen energetski certifikat koji je javno izložen na ulazu u zgradu Prirodoslovnog muzeja. Energetski certifikat omogućuje uvid u kvalitetu građevine sa stajališta potrošnje energije te je kategorizira u energetski razred prema energetskoj učinkovitosti od najnižeg G do najvišeg A i A+ razreda.