Dubrovačka Republika nije imala vlastite farmaceutske priručnike. Ljekarnici Male braće morali su se zato snalaziti kako su znali i mogli.
Koristili su farmakopeje iz cijele Europe, što do danas potvrđuje knjižni fond samostanske knjižnice. Uz najstariju medicinsku knjigu takve vrste, koja spada u inkunabulu, ‘Herbarius, seu de virtutibus herbarum’, tiskanu u Vicenci 1491., Mala braća čuvaju još mnogo stručnih medicinskih knjiga. Među njima su, samo primjera radi, farmaceutski priručnici:
Il Dioscoride dell’eccellente dottor medico m. P. Andrea Matthioli da Siena con li suoi discorsi da esso la terza uolta illustrati et copiosamente ampliati. Mantova 1549.;
Dubois Jacques. Methodus medicamenta componendi, ex simplicibus iudicio summo delectis, & arte certa paratis, quatuor libris distributa. Paris 1552. (knjiga izložena u muzeju);
Adam Lonicer. Kreuterbuch, kunstliche Conterfeytunge der Bäume, Stauden, Hecken, Kreuter, Getreyde, Gewürtze… Frankfurt am Main 1577. (knjiga izložena u muzeju);
Bairo Pietro. Secreti Medicinali … Ne i quali si contengono i rimedii, che si possono usar in tutte l’infermità, che vengono all huomo. Venezia 1592.
Giuseppe Santini. Ricettario medicinale. Serravalle di Vinetia 1604.;
Ulisse Aldrovandi Università di Bologna. Antidotarium Bononien: à medicinae Collegio nuperrime auctum, et emendatum, et amplissimo eiusdem ciuitatis Senatui dicatum. Bononiae 1641. (knjiga izložena u muzeju);
Joseph Du Chesne [Quercetano]. Le ricchezze della riformata farmacopea. Venetia 1651.;
Collegio de Spetiali. Antidotario Napolitano di nuouo riformato, e corretto dall’almo Collegio de Spetiali. Napoli 1653.;
Niccolo Lemery. Farmacopea universale. Amsterdam 1717. (knjiga izložena u muzeju);
Pharmacopoeia Bateana seu Pharmaca e Praxi. Venecija 1731. (knjiga izložena u muzeju);
Niccolo Lemery. Farmacopea universale. Venezia 1735.;
George Bate. Farmacopea Bateana, augmentada com os Segredos Goddardianos de Jonathan Goddardo. Pamplona 1763.;
Christian Friedrich Reuss. Dispensatorium universale. Argentorati 1787.;
Capello G. Battista. Lessico farmaceutico chimico. Venezia 1792.; i mnogi drugi.
Sami naslovi ovih stručnih knjiga potvrđuju svojevrsnu internacionalnost ljekarne Male braće. A rukopisi, koje su stvarali i kojima su se služili njeni ljekarnici, kao i slične knjige koje posjeduje knjižnica samostana, upućuju na veliko ljekarničko umijeće brojnih apotekara ove stare medicinske institucije.
Fra Stipe Nosić